Удостоен высшей государственной международной награды Турции - Премии Ататюрка - «за заслуги в прекращении военных действий в армяно-азербайджанском конфликте и целеустремленную политику, направленную на урегулирование этого конфликта».
С 1944-го -работал в органах госбезопасности Азербайджана.
В 1967 году стал председателем республиканского КГБ. Через два года избран первым секретарем ЦК КП Азербайджана.
В 1964 - 67 годах являлся зампредседателя Комитета государственной безопасности Азербайджана.
1974 - 1979 гг. - заместитель Председателя Совета Союза Верховного Совета СССР. С 1982-го — член Политбюро ЦК КПСС.
1982 - 1987 гг. - первый заместитель Председателя Совета Министров СССР. В 1987 году - выведен из состава Политбюро ЦК КПСС.
В 1990 году вышел из рядов коммунистической партии.
В 1991 году избран председателем парламента Нахчыванской Автономной Республики и заместителем председателя азербайджанского парламента.
1992 -1993 гг. - возглавлял партию «Новый Азербайджан».
В 1993 году - председатель Верховного Совета Азербайджанской Республики, одновременно исполнял обязанности Президента Азербайджанской Республики.
С 3 октября 1993 года - президент Азербайджана.
11 октября 1998 года во второй раз был избран президентом Азербайджанской Республики.
21 апреля 2003 года Алиеву дважды становилось плохо во время выступления по случаю 30-летия военного училища имени Джумшуда Нахичеванского.
3 мая Алиев был срочно доставлен из Баку в Анкару в Военно-медицинскую академию «Гюльханэ» в связи с резким ухудшением здоровья.
В мае 2003 года Алиев стал кавалером высшего ордена России - Андрея Первозванного.
2 октября 2003 года Гейдар Алиев отказался от участия в выборах президента Азербайджана. В своем обращении президент Азербайджана заявил о снятии своей кандидатуры в пользу премьер-министра Ильхама Алиева, являющегося его сыном.
12 декабря 2003 года скончался в Кливлендской клинике, штат Огайо, США.